הטכניון מקיים תוכנית ייחודית בארץ ובעולם ללימודים גבוהים (תואר שני ותואר שלישי) במתמטיקה יישומית במסגרת התוכנית הבין-יחידתית ללימודי מוסמכים. בתוכנית, המרוכזת בפקולטה למתמטיקה, משתתפות 11 פקולטות שונות מכל תחומי ההנדסה והמדעים. לכן ניתן להשתלם במגוון עצום של תחומי מחקר הכוללים בין היתר: אופטימיזציה, אופטיקה, אלסטיות, אנליזה נומרית, בקרה, גרפיקה ממוחשבת, הסתברות וסטטיסטיקה, חקר ביצועים, הידרודינמיקה, מודלים ברפואה ופיזיולוגיה, מכניקה, מתמטיקה חישובית, מערכות לומדות, מערכות נוירוניות, משוואות דיפרנציאליות, עיבוד אותות, עיבוד תמונות וראיה ממוחשבת, קריפטולוגיה, רובוטיקה, תורת המשחקים ועוד.
התכנית מעניקה מגוון מלגות לסטודנטים מצטיינים ומשרות של עמיתי הוראה בפקולטה למתמטיקה.
